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恶性肿瘤生物样本库标准操作流程
作者：
 杜祥 孙孟红 主编
定价：
60 元
页数：
179页
ISBN：
978-7-309-12556-6/R.1574
字数：
263千字
开本：
16 开
装帧：
平装
出版日期：
2016年9月 　　　　　　
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内容提要

       前言
      
       皎皎白驹，如梭过隙，10年转瞬而去！历经两年多的筹备，复旦大学附属肿瘤医院组织库正式成立于20０6年8月！从此改变了医院一直以来各自为政、零散取用的粗放型收集取用模式，成功转变为规范化、集中化的集约型生物样本收集管理模式。组织库从此配备专职技术人员、专用冰箱和专门场所，收集的样本至此纳入统一管理。10年来，组织库发展迅速，人员上从一个技术员到一支队伍，空间上从病理科一间不到20平方米的空间到500平方米的楼面，规模上从1台冰箱到今天拥有51台冰箱及大型液氮储存灌的大规模多形式储存，从尝试规范到实现规范，目前已然成为一个以集样本收集、处理、储存和分发等活动为主，同时承担国内生物样本库人员培训、对外样本共享服务、国际交流等多项生物样本库相关技术服务于一体的成熟生物样本库体系，正在为生物样本库事业、肿瘤的基础与临床转化研究发挥着越来越重要的作用。
       2004年我在上海参加一次学术会议，某位学者报告说其拥有的人源生物样本始于1960年，会后询问方知是石蜡包埋样本。而因为既往石蜡质量及保存方法上的缺陷，真正可用于科学研究的样本并不多。转而想到我院病理科1949年的石蜡样本亦保存至今，但由于储存空间及条件限制，真正有用的却寥寥无几。事实上我院病理科早就投入-80℃冰箱和小的液氮储存罐用于样本收集，为在读的研究生课题所配，但也存在一个问题，一旦研究生毕业或课题结束，这些宝贵生物样本的留存和去向没有人再去关心。相应的，我们渐渐认识到一方面研究者常常为收集存储样本苦恼，甚至束手无策，另一方面医院里珍贵的样本每天都在流失浪费。我们必须做点什么，这不仅是为现在的研究者，更是为未来的研究者谋福利，最终为肿瘤患者作贡献，由此产生了建立生物样本库的坚定信念。时值我院新楼建设，在医院领导的大力支持下，组织库出现在新楼的图纸上。然后有了去天津医科大学附属肿瘤医院和中山大学肿瘤防治中心组织库的学习之旅，同时加强和国外机构的生物样本库的联系和交流，开始了建设规范化生物样本库的历程。一路走来，样本库的建设十分不易，经历了一个个重要的关键点，如医院各层面对为科研留取生物样本资源的重要性的认同，各个科室放弃小我服从大我、主动及时与生物样本库联系合作；从研究生轮流“客串”生物样本库取材到第一个生物样本库技术员到岗；从兼职管理到专职管理；从一个病区一个病区挨个宣教知情同意的重要性到全院形成统一流程签署知情同意书；从职工在全院收入最低到提升为中等水平；从单纯收集分发样本到走向国际交流合作，通过我们医院全体人员的共同努力，样本库在规范建设之路上砥砺前行。
       生物样本库从其存在开始，就与科学息息相关，密不可分。生物样本是生物医药研究的“原油”，原材料是不可再生的，而且在它被收集的那一瞬间，其处理过程是否得当决定其质量，决定下游任何研究和分析的质量，直接影响科学研究的结果和由这一结果得出的结论。没有高质量的样本，就没有高质量的科学研究结果。由生物样本派生出的生物样本科学，是回答样本与科学研究密切联系的最好举动。生物样本科学将样本收集处理过程的变量与样本产出的结果联系起来，使得样本收集处理过程中的变量不再是一笔糊涂账，而是清晰的记录和可追溯的关联。
       规范地收集样本，是我们每天一点一滴积累和叠加的动作。样本数量的增长，是这份努力的结果。然而，收是为了用，样本使用是所有这些努力的目的。样本的使用管理，是生物样本库工作的重要部分。在过去的10年中，我们为科研提供了90000多个样本，支持了1094个科研项目，发表了878篇科研论文。而生物样本库成立以来，我院科研项目申请也呈现了逐年递增的态势。
       这10年，经历了从无到有、从少到多、从低到高的过程，复旦大学附属肿瘤医院组织库从医院库走到复旦库，从医院库走到上海库，经历了一个个里程碑。历数这10年的经历，我们得到了一次次提升。
       我们组织库有个“大事记”，其实都是“持续性改进”的足迹。时常翻开看看，使我们觉得，只有经过了这些磨砺和领悟，才能从中得以提升和进步。
       经过10年的积累，我们把生物样本库工作中的工作流程作了一次全面的总结和修改。这些文件，是在组织库具体工作实践中逐渐完善起来的规范，出自每一位技术人员之手。没有拔高、没有修饰，真实地把日常生物样本工作落在纸上。虽然SOP文件常常是指在实验室内部工作的方法，但我们愿意把这些第一手资料共享出来，揭去SOP文件的神秘面纱，还其朴实的本来面目。同时，SOP文件会随着技术的更新而产生新的版本，越来越完善，我们愿意看到我们的共享起到抛砖引玉的作用。
      
       杜祥
       2016年8月
      

作者简介

书摘

       目录
      
       第一章 样本管理
       第一节 知情同意书的签署
       一、知情同意书的签署
       二、知情同意撤销操作规程
       第二节 采集
       一、样本采集控制程序
       二、组织样本采集操作规程
       三、乳腺肿瘤取材规程
       四、肠肿瘤取材规程
       五、胃肿瘤样本取材规程
       六、肝脏肿瘤样本采集规程
       七、胰腺肿瘤取材规程
       八、妇科肿瘤取材规程
       九、肾脏肿瘤取材规程
       十、输尿管切除术标本取材规程
       十一、肾上腺肿瘤取材规程
       十二、前列腺肿瘤取材规程
       十三、膀胱切除术标本取材规程
       十四、肺肿瘤取材规程
       十五、淋巴瘤取材规程
       十六、外周血及细胞学样本采集操作规程
       第三节 接收
       一、外周血样本的接收
       二、体液样本的接收
       三、淋巴瘤样本的接收
       四、课题样本的接收
       五、外来样本的接收
       第四节 处理
       一、组织样本处理操作规程
       二、组织样本OCT包埋及冷冻切片制作操作规程
       三、石蜡组织切片制作操作规程
       四、组织标本石蜡切片HE染色封片操作规程
       五、外周血样本处理及入库操作规程
       六、尿液样本处理及入库操作规程
       七、胸腹水样本处理及入库操作规程
       第五节 保存
       一、样本储存控制规程
       二、条码标签设定使用规程
       三、组织样本储存操作规程
       四、胸腔积液、腹水和尿液样本储存操作规程
       五、血液样本储存操作规程
       六、cDNA的保存规程
       七、OCT包埋样本的保存操作规程
       八、科研蜡块样本的保存操作规程
       九、石蜡切片样本的保存操作规程
       十、库存复核操作规程
       第六节 样本取用规程
       一、样本使用及反馈管理办法
       二、样本销毁控制程序
       三、样本运输控制程序
       第七节 组织芯片的制作
       一、科研蜡块的归档和储存规程
       二、组织芯片制作的申请规程
       三、组织芯片的制作方法
       四、组织芯片的切片制作及保存
       五、组织芯片的取用规程
      
       第二章 设备管理
       一、组织库冰箱维护保养规程
       二、METTLERTOLEDO电子天平操作和维护保养规程
       三、METTLERTOLEDO实验室pH计操作和维护保养规程
       四、Precellys 24均质器操作规程
       五、冷冻切片机操作和维护保养规程
       六、病理取材台操作和维护保养规程
       七、生物安全柜操作和维护保养规程
       八、MilliQ纯水超纯水一体机操作和维护保养规程
       九、离心机操作和维护保养规程
       十、石蜡切片机操作和维护保养规程
       十一、手动组织芯片仪操作和维护保养规程
       十二、RHS1多功能微波组织处理仪操作和维护保养规程
       十三、温度监控管理系统MTR2006
       十四、液氮罐操作和维护保养规程
       十五、移液器操作和维护保养规程
       十六、组织包埋机操作和维护保养规程
       十七、制冰机操作和维护保养规程
       十八、紫外消毒灯操作和维护保养规程
       十九、通风橱操作和维护保养规程
       二十、显微镜操作和维护保养规程
       二十一、GR60DF灭菌锅操作和维护保养规程
       二十二、SYNERGY微孔板读取仪操作和维护保养规程
       二十三、全自动液体分装工作站操作和维护保养规程
       二十四、全自动核酸提取工作站操作和维护保养规程
       二十五、复合式紧急喷淋洗眼器维护保养规程
       二十六、恒温干燥箱维护保养规程
      
       第三章 质量控制
       一、核酸提取和纯化控制程序
       二、血凝块DNA提取方法
       三、白细胞DNA提取方法
       四、组织总RNA提取方法
       五、NanoVue分光光度计操作规程
       六、琼脂糖凝胶电泳步骤
       七、Agilent 2100简要操作步骤
       八、肿瘤组织病理形态学评估操作规程
       九、组织库质量控制程序
      
       第四章 信息管理
       一、组织库冻存管理系统操作和维护保养规程
       二、原始纸质记录的归档与装订
       三、计算机数据备份操作规程
       四、保密程序规范
      
       第五章 内务管理
       一、持续性改进
       二、废物分类及处理程序
       三、纠正措施程序
       四、人员培训及考核管理程序
       五、人员准入程序和参观登记程序
       六、设施与环境管理程序
       七、实验室事故报告与处理程序
       八、试剂耗材管理程序
       九、仪器设备采购控制程序
       十、预防措施程序
       十一、质量监督管理程序
       十二、(超)低温冰箱应急操作规程
       十三、应急预案控制性程序
       十四、组织库人员信息
      
       第六章 特色样本库样本操作流程
       一、上海交通大学医学院附属第九人民医院骨科样本（肿瘤）
       取材SOP文件
       二、复旦大学附属儿科医院样本处理SOP一期
       三、同济大学附属上海市肺科医院肺小标本处理及入库操作流程
       四、复旦大学附属华东医院生物标本库SOP文件
       五、复旦大学附属眼耳鼻喉科医院SOP文件
       六、第二军医大学附属长海医院SOP文件
      
       主要参考文献
      

书评       
　  

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